Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH2Q12809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH2Q12809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KCNH2Q12809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH2Q12809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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