Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF3C1Q12789 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C1Q12789 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C1Q12789 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C1Q12789 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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GTF3C1Q12789 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C1Q12789 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C1Q12789 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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