Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SREBF2Q12772 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SREBF2Q12772 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SREBF2Q12772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SREBF2Q12772 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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