Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PAX8Q06710 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAX8Q06710 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PAX8Q06710 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms