Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC63Q05C16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC63Q05C16 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC63Q05C16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms