Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF1Q05048 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF1Q05048 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF1Q05048 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms