Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL6Q02878 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL6Q02878 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms