Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNA1P78396 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA1P78396 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNA1P78396 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNA1P78396 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNA1P78396 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNA1P78396 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNA1P78396 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNA1P78396 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNA1P78396 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCNA1P78396 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCNA1P78396 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNA1P78396 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms