Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCE1P61221 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCE1P61221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.8 ms