Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYBA4P53673 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYBA4P53673 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms