Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRE11P49959 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRE11P49959 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRE11P49959 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRE11P49959 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRE11P49959 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MRE11P49959 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRE11P49959 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRE11P49959 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRE11P49959 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRE11P49959 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRE11P49959 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRE11P49959 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRE11P49959 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRE11P49959 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRE11P49959 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRE11P49959 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRE11P49959 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRE11P49959 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRE11P49959 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRE11P49959 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRE11P49959 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRE11P49959 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRE11P49959 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRE11P49959 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRE11P49959 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms