Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSEN2P49810 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSEN2P49810 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSEN2P49810 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSEN2P49810 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms