Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPAP49450 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPAP49450 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPAP49450 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPAP49450 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPAP49450 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPAP49450 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPAP49450 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPAP49450 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPAP49450 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CENPAP49450 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPAP49450 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPAP49450 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPAP49450 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPAP49450 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPAP49450 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPAP49450 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPAP49450 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPAP49450 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPAP49450 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPAP49450 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPAP49450 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms