Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIK3CGP48736 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CGP48736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CGP48736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CGP48736 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CGP48736 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CGP48736 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CGP48736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms