Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSOP43234 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSOP43234 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSOP43234 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSOP43234 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSOP43234 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSOP43234 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSOP43234 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSOP43234 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSOP43234 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSOP43234 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSOP43234 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSOP43234 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSOP43234 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSOP43234 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSOP43234 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSOP43234 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSOP43234 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSOP43234 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSOP43234 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSOP43234 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSOP43234 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSOP43234 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSOP43234 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSOP43234 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSOP43234 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSOP43234 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSOP43234 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSOP43234 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSOP43234 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSOP43234 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSOP43234 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSOP43234 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSOP43234 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSOP43234 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTSOP43234 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSOP43234 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms