Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP1P28562 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP1P28562 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP1P28562 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms