Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLD1P28340 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLD1P28340 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLD1P28340 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLD1P28340 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLD1P28340 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLD1P28340 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLD1P28340 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
POLD1P28340 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLD1P28340 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLD1P28340 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLD1P28340 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLD1P28340 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLD1P28340 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLD1P28340 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLD1P28340 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLD1P28340 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLD1P28340 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLD1P28340 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLD1P28340 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLD1P28340 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLD1P28340 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLD1P28340 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLD1P28340 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLD1P28340 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLD1P28340 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLD1P28340 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLD1P28340 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLD1P28340 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLD1P28340 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
POLD1P28340 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLD1P28340 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLD1P28340 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLD1P28340 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLD1P28340 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLD1P28340 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLD1P28340 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLD1P28340 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLD1P28340 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLD1P28340 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLD1P28340 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLD1P28340 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLD1P28340 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLD1P28340 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLD1P28340 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLD1P28340 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLD1P28340 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLD1P28340 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLD1P28340 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLD1P28340 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLD1P28340 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLD1P28340 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLD1P28340 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLD1P28340 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLD1P28340 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLD1P28340 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.3 ms