Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDCP20941 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCP20941 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCP20941 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCP20941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCP20941 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDCP20941 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCP20941 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCP20941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCP20941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCP20941 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDCP20941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDCP20941 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCP20941 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCP20941 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCP20941 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCP20941 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCP20941 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCP20941 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCP20941 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCP20941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCP20941 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCP20941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCP20941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCP20941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCP20941 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCP20941 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCP20941 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCP20941 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCP20941 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCP20941 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCP20941 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCP20941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCP20941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCP20941 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCP20941 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCP20941 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCP20941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCP20941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCP20941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCP20941 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCP20941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCP20941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCP20941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms