Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A1P19634 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC9A1P19634 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC9A1P19634 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC9A1P19634 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms