Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2CP19387 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2CP19387 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2CP19387 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms