Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIP12755 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIP12755 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKIP12755 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKIP12755 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIP12755 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIP12755 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIP12755 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIP12755 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIP12755 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIP12755 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIP12755 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIP12755 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIP12755 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIP12755 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIP12755 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIP12755 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIP12755 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKIP12755 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIP12755 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIP12755 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIP12755 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIP12755 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIP12755 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIP12755 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIP12755 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIP12755 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIP12755 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIP12755 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIP12755 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIP12755 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIP12755 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIP12755 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIP12755 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIP12755 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIP12755 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms