Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BCRP11274 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BCRP11274 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BCRP11274 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BCRP11274 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BCRP11274 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BCRP11274 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCRP11274 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BCRP11274 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BCRP11274 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BCRP11274 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCRP11274 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCRP11274 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BCRP11274 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCRP11274 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BCRP11274 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCRP11274 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCRP11274 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCRP11274 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCRP11274 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCRP11274 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCRP11274 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCRP11274 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCRP11274 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCRP11274 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCRP11274 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BCRP11274 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BCRP11274 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCRP11274 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BCRP11274 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCRP11274 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCRP11274 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCRP11274 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCRP11274 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCRP11274 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCRP11274 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCRP11274 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCRP11274 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCRP11274 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCRP11274 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCRP11274 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCRP11274 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCRP11274 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCRP11274 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms