Protein–RNA interactions for Protein: P10915

HAPLN1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN1P10915 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HAPLN1P10915 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HAPLN1P10915 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HAPLN1P10915 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HAPLN1P10915 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms