Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPRFP10586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRFP10586 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPRFP10586 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms