Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VIL1P09327 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VIL1P09327 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VIL1P09327 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VIL1P09327 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VIL1P09327 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VIL1P09327 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VIL1P09327 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VIL1P09327 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VIL1P09327 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VIL1P09327 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
VIL1P09327 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VIL1P09327 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VIL1P09327 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VIL1P09327 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VIL1P09327 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VIL1P09327 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VIL1P09327 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VIL1P09327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VIL1P09327 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VIL1P09327 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VIL1P09327 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VIL1P09327 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VIL1P09327 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VIL1P09327 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VIL1P09327 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VIL1P09327 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIL1P09327 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIL1P09327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIL1P09327 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIL1P09327 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VIL1P09327 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VIL1P09327 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VIL1P09327 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VIL1P09327 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VIL1P09327 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VIL1P09327 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIL1P09327 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIL1P09327 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VIL1P09327 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VIL1P09327 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VIL1P09327 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
VIL1P09327 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIL1P09327 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIL1P09327 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VIL1P09327 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIL1P09327 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIL1P09327 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIL1P09327 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIL1P09327 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VIL1P09327 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIL1P09327 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VIL1P09327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms