Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBSP08397 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBSP08397 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBSP08397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBSP08397 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HMBSP08397 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBSP08397 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBSP08397 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBSP08397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBSP08397 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMBSP08397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMBSP08397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMBSP08397 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMBSP08397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMBSP08397 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMBSP08397 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBSP08397 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMBSP08397 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HMBSP08397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBSP08397 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMBSP08397 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMBSP08397 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMBSP08397 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMBSP08397 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMBSP08397 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBSP08397 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMBSP08397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMBSP08397 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMBSP08397 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMBSP08397 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBSP08397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBSP08397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMBSP08397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMBSP08397 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMBSP08397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMBSP08397 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMBSP08397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMBSP08397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms