Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP2P08253 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP2P08253 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP2P08253 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP2P08253 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP2P08253 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP2P08253 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP2P08253 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP2P08253 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP2P08253 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP2P08253 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP2P08253 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP2P08253 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP2P08253 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP2P08253 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP2P08253 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP2P08253 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP2P08253 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP2P08253 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP2P08253 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP2P08253 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP2P08253 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP2P08253 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP2P08253 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP2P08253 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP2P08253 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP2P08253 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP2P08253 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP2P08253 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP2P08253 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP2P08253 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP2P08253 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP2P08253 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP2P08253 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms