Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGAVP06756 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAVP06756 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms