Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOP3BO95985 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP3BO95985 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOP3BO95985 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms