Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI1O95970 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI1O95970 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI1O95970 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI1O95970 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGI1O95970 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI1O95970 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI1O95970 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI1O95970 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI1O95970 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI1O95970 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI1O95970 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI1O95970 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGI1O95970 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGI1O95970 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGI1O95970 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGI1O95970 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGI1O95970 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGI1O95970 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LGI1O95970 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI1O95970 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LGI1O95970 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LGI1O95970 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms