Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB6O95452 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB6O95452 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB6O95452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB6O95452 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB6O95452 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB6O95452 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB6O95452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB6O95452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB6O95452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB6O95452 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB6O95452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB6O95452 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB6O95452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB6O95452 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB6O95452 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB6O95452 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB6O95452 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB6O95452 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB6O95452 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB6O95452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB6O95452 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB6O95452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB6O95452 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB6O95452 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB6O95452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB6O95452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB6O95452 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB6O95452 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB6O95452 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB6O95452 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB6O95452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB6O95452 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB6O95452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB6O95452 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB6O95452 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB6O95452 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB6O95452 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB6O95452 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB6O95452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB6O95452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB6O95452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB6O95452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB6O95452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms