Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABLIM3O94929 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABLIM3O94929 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABLIM3O94929 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABLIM3O94929 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms