Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE3O75131 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE3O75131 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE3O75131 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE3O75131 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms