Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRGAP2O75044 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2O75044 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms