Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDH7O60245 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH7O60245 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH7O60245 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms