Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITM2AO43736 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITM2AO43736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms