Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01565O15544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01565O15544 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms