Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1O15118 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1O15118 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1O15118 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1O15118 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1O15118 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1O15118 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1O15118 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1O15118 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1O15118 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1O15118 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1O15118 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1O15118 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1O15118 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPC1O15118 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPC1O15118 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1O15118 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1O15118 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1O15118 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPC1O15118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1O15118 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1O15118 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPC1O15118 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPC1O15118 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPC1O15118 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1O15118 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1O15118 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1O15118 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPC1O15118 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1O15118 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1O15118 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1O15118 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1O15118 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1O15118 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1O15118 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1O15118 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1O15118 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPC1O15118 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1O15118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1O15118 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms