Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7AO14910 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN7AO14910 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN7AO14910 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms