Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WNT9AO14904 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WNT9AO14904 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
WNT9AO14904 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
WNT9AO14904 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms