Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF103O00237 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF103O00237 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF103O00237 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF103O00237 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF103O00237 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF103O00237 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF103O00237 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF103O00237 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF103O00237 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF103O00237 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF103O00237 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF103O00237 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF103O00237 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF103O00237 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF103O00237 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF103O00237 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF103O00237 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF103O00237 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF103O00237 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF103O00237 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF103O00237 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms