Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV0

KLRC4-KLRK1, KLRC4-KLRK1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLRC4-KLRK1H3BQV0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms