Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227AF5H4B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms