Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E5RI56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E5RI56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E5RI56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E5RI56 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E5RI56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E5RI56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E5RI56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E5RI56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E5RI56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E5RI56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E5RI56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E5RI56 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E5RI56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E5RI56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E5RI56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E5RI56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E5RI56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E5RI56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E5RI56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E5RI56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E5RI56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E5RI56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E5RI56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E5RI56 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E5RI56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E5RI56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E5RI56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E5RI56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E5RI56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E5RI56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E5RI56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E5RI56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
E5RI56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E5RI56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E5RI56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E5RI56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E5RI56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E5RI56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms