Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB1P1B2RPK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB1P1B2RPK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms