Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZK1P1A8MUH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZK1P1A8MUH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms