Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYSRT1A8MQ03 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CYSRT1A8MQ03 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.8 ms