Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF233A6NK53 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF233A6NK53 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF233A6NK53 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF233A6NK53 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms