Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM187AA6NFU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM187AA6NFU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms