Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.135e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-206ENST00000460794 568 ntTSL 27.96□□□□□ -1.145e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-215ENST00000482544 768 ntTSL 37.29□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.491e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.568e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.578e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 USP34-215ENST00000484179 927 ntTSL 34.56□□□□□ -1.685e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 USP34-205ENST00000453734 2708 ntTSL 1 (best)2.67□□□□□ -1.985e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-206ENST00000373728 1349 ntTSL 29.38□□□□□ -0.913e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MED1-203ENST00000577831 4584 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.033e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-211ENST00000470366 1186 ntTSL 57.93□□□□□ -1.143e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.143e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 RAB10-203ENST00000473035 571 ntTSL 46.93□□□□□ -1.33e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.363e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 RAB10-202ENST00000462003 584 ntTSL 46.01□□□□□ -1.453e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-204ENST00000373724 884 ntTSL 55.94□□□□□ -1.463e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.583e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-209ENST00000441707 858 ntTSL 25.09□□□□□ -1.593e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.67□□□□□ -1.663e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 MRRF-205ENST00000373727 703 ntTSL 34.49□□□□□ -1.693e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-10■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.572e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SIGMAR1-202ENST00000353468 1582 ntTSL 1 (best)19.64■□□□□ 0.732e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.77□□□□□ -0.532e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.72e-8■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.742e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.23■■□□□ 1.472e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 AL020996.2-201ENST00000559265 568 ntTSL 419.84■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 TIMM29-202ENST00000588807 859 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 GSK3A-204ENST00000493059 761 ntTSL 211.43□□□□□ -0.587e-9■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.636e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.556e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.026e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.226e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.336e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.436e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.466e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.596e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.856e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SOS1-IT1-203ENST00000609942 664 ntTSL 55.56□□□□□ -1.526e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SOS1-IT1-202ENST00000594472 1191 ntTSL 55.29□□□□□ -1.566e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.646e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.22□□□□□ -2.056e-10■□□□□ 8.2
ILF3Q12906 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 510.16□□□□□ -0.783e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GDI1-206ENST00000465640 754 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-204ENST00000445146 682 ntTSL 317.6■□□□□ 0.411e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 417.55■□□□□ 0.41e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-205ENST00000468308 763 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-206ENST00000474182 465 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GDI1-207ENST00000468483 2417 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.551e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GDI1-214ENST00000491154 4069 ntTSL 29.53□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-8■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC074117.1-202ENST00000453289 536 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 320.82■□□□□ 0.922e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 319.4■□□□□ 0.72e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PDE4A-206ENST00000589073 1703 ntTSL 519.1■□□□□ 0.652e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 318.98■□□□□ 0.632e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 GIPR-207ENST00000591322 557 ntTSL 416.42■□□□□ 0.222e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 513.27□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PDE4A-207ENST00000590407 1770 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-211ENST00000528840 456 ntTSL 211.37□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-216ENST00000534796 900 ntTSL 310.69□□□□□ -0.72e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-204ENST00000475464 366 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.052e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-208ENST00000524384 663 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 27.97□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 36.06□□□□□ -1.442e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 53.81□□□□□ -1.82e-7■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.845e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.645e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.355e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.15e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 515.08■□□□□ 05e-10■□□□□ 8.1
ILF3Q12906 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 214.95□□□□□ -0.025e-10■□□□□ 8.1
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